De acordo como que foi apurado pela polícia, o rapaz era um dos passageiros de um automóvel GM Celta, o qual seguia pela rodovia, sentido litoral, quando, ao chegar no Km 6, na região da Colônia Quintilha, se envolveu em um acidente, que acabou em capotamento seguido de saída de pista. No carro estavam mais três pessoas que se feriram sem gravidade.
Socorrido pelo Samu, Jhonatan foi encaminhado imediatamente à casa de saúde em Paranaguá, mas não conseguiu se recuperar e acabou entrando em óbito na quinta-feira (6). O rapaz residia no bairro Bom Retiro, na cidade de Matinhos.